,晉爵鄂國公,加太子太傅。

1650年夏,馬進忠自八十里山出屯於興安之西延鎮。

是年冬,孫可望在貴陽,假詔敕稱秦王,總統天下兵馬,召馬進忠,馬進忠率全軍附於孫可望。

1652年,李定國出雲南,孫可望令馬進忠隨定國出師湖南,連戰皆捷,大破清軍,使南明抗清戰局復振。

不過,因為孫可望暗中給李定國拆臺,命令馮雙禮撤軍,馮軍撤走,馬進忠也隨之而走,怒坑李定國一把,使得衡州戰役沒有取得最大效果。

因為馬進忠等人的離去,使得李定國大軍要孤軍作戰,李定國確實是百戰名將,頂著尼堪大軍的巨大壓力,仍然將尼堪擊斃,但因為所屬兵力不足,只能無奈被迫放棄衡州。

不過也正因如此,馬進忠被朝廷解除兵權,最終悲憤成疾,卒於貴陽,結束了自己的一身。